Помпы бывают погружные и внешние.
Погружные- это помпы, как следует из названия, для работы которых необходимо полное погружение в рабочую жидкость. Это самые распространённые помпы, но как правило они плохо герметизированы и редко бывают высокого качества:

Внешние- могут устанавливаться в любом удобном месте корпуса, занимают значительно меньше места, так как отпадает нужда в большом расширительном бачке, но стоят дороже:

примечание: практически любая погружная помпа может быть переделана во внешнюю. У каждого типа помп есть свои плюсы и минусы. Что использовать, решать вам.

Ещё помпы бывают аквариумные и фонтанные. Фонтанные помпы больше подходят для построения системы ВО, они обеспечивают более высокий подъём воды. Аквариумные помпы- AquaEl, Unistar. Фонтанные- Hydor, Sicce. Тут нужно отметить, что почти у каждого производителя есть линейки аквариумных помп и фонтанных, отличаются они параметрами и комплектацией.

1. Уровень подъёма воды- это первое, на что надо обратить внимание. Эту характеристику можно сравнить с приемистостью двигателя автомобиля. Однозначно, чем больше это число, тем лучше. Современные помпы, разработанные специально для систем ВО, могут "поднимать" воду на 3.5 м и выше, аквариумные (и фонтанные) на такое не способны. Выбирать нужно значение от 1м и выше.

2. Объём воды, который помпа может прокачать за единицу времени. Величина обозначается л/ч. Обычно хватает 600 л/ч. Выбирать надо между 700- 1300 л/ч. Больше, думаю, не надо. Больший объём обеспечивают циркуляционные насосы, но это отдельная тема.
примечание: нельзя не упомянуть "китайские" литры, стоит верить характеристикам только фирменных помп, так как китайские значения могут быть сильно преувеличены. По статистике, фирменная помпа 700 л/ч легко "расправляется" с тремя блоками и радиатором от печки автомобиля.

3. Мощность. На мой взгляд, неоднозначная величина, но всё таки чем она меньше, тем лучше. Хотя загоняться этим параметром не надо. Хватит 10- 20 Вт.

Таким образом необходимо выбрать помпу с возможно большими значениями 1 и 2, и с наименьшей мощностью, ибо можно взять мощную, но две важные характеристики будут не удовлетворять условиям.

Есть несколько способов решения данной проблемы. Всё зависит от издаваемого шума: вибрация и гудение.
Иногда немного заглушить шум позволяет фиксация крыльчатки. Конструкция ротора некоторых помп такова, что позволяет крыльчатке иметь некоторый люфт, от него желательно избавиться. Надо снять крыльчатку, если она это позволяет, капнуть суперклея и собрать обратно:

Если конструкция неразборная, то просто капнуть клея в место соприкосновения крыльчатки и ротора.
От вибрации позволяет избавится кусок поролона, подложенный под помпу. Желательно шланг, который идёт к помпе, выбрать мягкий, например, из мецицинского силикона. Тогда вибрация от помпы не будет передаваться по шлангам дальше. Некоторые полностью заворачивают помпу в поролон, оставляя дырки "для дыхания".
Есть способ подвешивания помпы внутри системника на пружинах, что тоже позволяет избавиться от вибрации.
Причиной шума может стать и воздух, попавший в помпу, надо от него избавиться.
Если помпа после таких манипуляций всё равно сильно гудит, то это некачественное изделие, для сохранения нервных клеток его нужно заменить чем-нибудь более пристойным.